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gcc error
Date: 2014/11/27 06:10
Name: William

Somebody can help me with this problem.

Thank you


mpicc -openmp -O3 -I/usr/local/include -Dnoomp -I./liberi-091216/source openmx.o openmx_common.o Input_std.o Inputtools.o init.o LU_inverse.o ReLU_inverse.o truncation.o readfile.o FT_PAO.o FT_NLP.o FT_ProExpn_VNA.o FT_VNA.o FT_ProductPAO.o Hamiltonian_Cluster.o Overlap_Cluster.o Hamiltonian_Band.o Overlap_Band.o Hamiltonian_Cluster_NC.o Hamiltonian_Band_NC.o Hamiltonian_Cluster_SO.o Get_OneD_HS_Col.o SetPara_DFT.o XC_Ceperly_Alder.o XC_CA_LSDA.o XC_PW92C.o XC_PBE.o XC_EX.o DFT.o Mixing_DM.o Force.o Poisson.o Poisson_ESM.o Cluster_DFT.o Cluster_DFT_Dosout.o Cluster_DFT_ON2.o Band_DFT_Col.o Band_DFT_NonCol.o Band_DFT_kpath.o Band_DFT_MO.o Band_DFT_Dosout.o Set_Density_Grid.o Set_Orbitals_Grid.o Set_Aden_Grid.o Gauss_Legendre.o zero_cfrac.o xyz2spherical.o AngularF.o RadialF.o Dr_RadialF.o PhiF.o VNAF.o Dr_VNAF.o VH_AtomF.o Dr_VH_AtomF.o RF_BesselF.o QuickSort.o Nonlocal_RadialF.o KumoF.o Dr_KumoF.o Mulliken_Charge.o Occupation_Number_LDA_U.o Eff_Hub_Pot.o EulerAngle_Spin.o Smoothing_Func.o Orbital_Moment.o Pot_NeutralAtom.o Simple_Mixing_DM.o DIIS_Mixing_DM.o GR_Pulay_DM.o Kerker_Mixing_Rhok.o DIIS_Mixing_Rhok.o Total_Energy.o Contract_Hamiltonian.o Contract_iHNL.o Cont_Matrix0.o Cont_Matrix1.o Cont_Matrix2.o Cont_Matrix3.o Cont_Matrix4.o Opt_Contraction.o Initial_CntCoes.o Initial_CntCoes2.o Set_XC_Grid.o Get_Orbitals.o Get_dOrbitals.o Get_Cnt_Orbitals.o Get_Cnt_dOrbitals.o Gaunt.o Find_CGrids.o MD_pac.o RestartFileDFT.o Output_CompTime.o Merge_LogFile.o Make_FracCoord.o Make_InputFile_with_FinalCoord.o Divide_Conquer.o Krylov.o Divide_Conquer_Dosout.o Eigen_lapack.o Eigen_lapack2.o EigenBand_lapack.o Eigen_PReHH.o BroadCast_ReMatrix.o Eigen_PHH.o BroadCast_ComplexMatrix.o lapack_dstedc1.o lapack_dstedc2.o lapack_dstedc3.o lapack_dstegr1.o lapack_dstegr2.o lapack_dstegr3.o lapack_dstevx1.o lapack_dstevx2.o lapack_dstevx3.o lapack_dstevx4.o lapack_dstevx5.o lapack_dsteqr1.o Nonlocal_Basis.o Set_OLP_Kin.o Set_Nonlocal.o Set_ProExpn_VNA.o Set_Hamiltonian.o Set_Vpot.o Voronoi_Charge.o Voronoi_Orbital_Moment.o Fuzzy_Weight.o dampingF.o deri_dampingF.o Spherical_Bessel.o iterout.o iterout_md.o Allocate_Arrays.o Free_Arrays.o Init_List_YOUSO.o outputfile1.o malloc_multidimarray.o PrintMemory.o PrintMemory_Fix.o dtime.o OutData.o OutData_Binary.o init_alloc_first.o File_CntCoes.o SCF2File.o mimic_sse.o Make_Comm_Worlds.o Set_Allocate_Atom2CPU.o Cutoff.o Generating_MP_Special_Kpt.o Maketest.o Runtest.o Memory_Leak_test.o Force_test.o Show_DFT_DATA.o Generate_Wannier.o TRAN_Allocate.o TRAN_DFT.o TRAN_DFT_Dosout.o TRAN_Apply_Bias2e.o TRAN_Deallocate_Electrode_Grid.o TRAN_Deallocate_RestartFile.o TRAN_RestartFile.o TRAN_Calc_CentGreen.o TRAN_Input_std.o TRAN_Set_CentOverlap.o TRAN_Calc_CentGreenLesser.o TRAN_Input_std_Atoms.o TRAN_Set_Electrode_Grid.o TRAN_Calc_GridBound.o TRAN_Set_IntegPath.o TRAN_Output_HKS.o TRAN_Set_MP.o TRAN_Calc_SelfEnergy.o TRAN_Output_Trans_HS.o TRAN_Calc_Hopping_G.o TRAN_Calc_SurfGreen.o TRAN_Set_SurfOverlap.o TRAN_Add_Density_Lead.o TRAN_Add_ADensity_Lead.o TRAN_Set_Value.o TRAN_Poisson.o TRAN_adjust_Ngrid.o TRAN_Print.o TRAN_Print_Grid.o Lapack_LU_inverse.o TRAN_Distribute_Node.o TRAN_Output_HKS_Write_Grid.o TRAN_Credit.o TRAN_Check_Region_Lead.o TRAN_Check_Region.o TRAN_Check_Input.o DFTDvdW_init.o neb.o neb_run.o neb_check.o TRAN_Allocate_NC.o TRAN_DFT_NC.o TRAN_Set_CentOverlap_NC.o TRAN_Set_SurfOverlap_NC.o elpa1.o solve_evp_real.o solve_evp_complex.o exx.o exx_index.o exx_vector.o exx_log.o exx_step1.o exx_step2.o exx_file_overlap.o exx_file_eri.o exx_interface_openmx.o exx_debug.o exx_xc.o exx_rhox.o ./liberi-091216/source/eri.o ./liberi-091216/source/eri_ll.o ./liberi-091216/source/eri_sf.o ./liberi-091216/source/eri_interpolate.o ./liberi-091216/source/eri_gtbl.o ./liberi-091216/source/sbt/eri_sbt.o ./liberi-091216/source/sbt/log/eri_fsbt.o ./liberi-091216/source/sbt/log/eri_logfsbt.o ./liberi-091216/source/sbt/linear/eri_linfsbt.o -L/usr/local/lib -lfftw3 -llapack -lblas -lg2c -static -lm -o openmx
gcc: error: openmx.o: No existe el archivo o el directorio
gcc: error: openmx_common.o: No existe el archivo o el directorio
gcc: error: Input_std.o: No existe el archivo o el directorio
gcc: error: Inputtools.o: No existe el archivo o el directorio
gcc: error: init.o: No existe el archivo o el directorio
gcc: error: LU_inverse.o: No existe el archivo o el directorio
gcc: error: ReLU_inverse.o: No existe el archivo o el directorio
gcc: error: truncation.o: No existe el archivo o el directorio
gcc: error: readfile.o: No existe el archivo o el directorio
gcc: error: FT_PAO.o: No existe el archivo o el directorio
gcc: error: FT_NLP.o: No existe el archivo o el directorio
gcc: error: FT_ProExpn_VNA.o: No existe el archivo o el directorio
gcc: error: FT_VNA.o: No existe el archivo o el directorio
gcc: error: FT_ProductPAO.o: No existe el archivo o el directorio
gcc: error: Hamiltonian_Cluster.o: No existe el archivo o el directorio
gcc: error: Overlap_Cluster.o: No existe el archivo o el directorio
gcc: error: Hamiltonian_Band.o: No existe el archivo o el directorio
gcc: error: Overlap_Band.o: No existe el archivo o el directorio
gcc: error: Hamiltonian_Cluster_NC.o: No existe el archivo o el directorio
gcc: error: Hamiltonian_Band_NC.o: No existe el archivo o el directorio
gcc: error: Hamiltonian_Cluster_SO.o: No existe el archivo o el directorio
gcc: error: Get_OneD_HS_Col.o: No existe el archivo o el directorio
gcc: error: SetPara_DFT.o: No existe el archivo o el directorio
gcc: error: XC_Ceperly_Alder.o: No existe el archivo o el directorio
gcc: error: XC_CA_LSDA.o: No existe el archivo o el directorio
gcc: error: XC_PW92C.o: No existe el archivo o el directorio
gcc: error: XC_PBE.o: No existe el archivo o el directorio
gcc: error: XC_EX.o: No existe el archivo o el directorio
gcc: error: DFT.o: No existe el archivo o el directorio
gcc: error: Mixing_DM.o: No existe el archivo o el directorio
gcc: error: Force.o: No existe el archivo o el directorio
gcc: error: Poisson.o: No existe el archivo o el directorio
gcc: error: Poisson_ESM.o: No existe el archivo o el directorio
gcc: error: Cluster_DFT.o: No existe el archivo o el directorio
gcc: error: Cluster_DFT_Dosout.o: No existe el archivo o el directorio
gcc: error: Cluster_DFT_ON2.o: No existe el archivo o el directorio
gcc: error: Band_DFT_Col.o: No existe el archivo o el directorio
gcc: error: Band_DFT_NonCol.o: No existe el archivo o el directorio
gcc: error: Band_DFT_kpath.o: No existe el archivo o el directorio
gcc: error: Band_DFT_MO.o: No existe el archivo o el directorio
gcc: error: Band_DFT_Dosout.o: No existe el archivo o el directorio
gcc: error: Set_Density_Grid.o: No existe el archivo o el directorio
gcc: error: Set_Orbitals_Grid.o: No existe el archivo o el directorio
gcc: error: Set_Aden_Grid.o: No existe el archivo o el directorio
gcc: error: Gauss_Legendre.o: No existe el archivo o el directorio
gcc: error: zero_cfrac.o: No existe el archivo o el directorio
gcc: error: xyz2spherical.o: No existe el archivo o el directorio
gcc: error: AngularF.o: No existe el archivo o el directorio
gcc: error: RadialF.o: No existe el archivo o el directorio
gcc: error: Dr_RadialF.o: No existe el archivo o el directorio
gcc: error: PhiF.o: No existe el archivo o el directorio
gcc: error: VNAF.o: No existe el archivo o el directorio
gcc: error: Dr_VNAF.o: No existe el archivo o el directorio
gcc: error: VH_AtomF.o: No existe el archivo o el directorio
gcc: error: Dr_VH_AtomF.o: No existe el archivo o el directorio
gcc: error: RF_BesselF.o: No existe el archivo o el directorio
gcc: error: QuickSort.o: No existe el archivo o el directorio
gcc: error: Nonlocal_RadialF.o: No existe el archivo o el directorio
gcc: error: KumoF.o: No existe el archivo o el directorio
gcc: error: Dr_KumoF.o: No existe el archivo o el directorio
gcc: error: Mulliken_Charge.o: No existe el archivo o el directorio
gcc: error: Occupation_Number_LDA_U.o: No existe el archivo o el directorio
gcc: error: Eff_Hub_Pot.o: No existe el archivo o el directorio
gcc: error: EulerAngle_Spin.o: No existe el archivo o el directorio
gcc: error: Smoothing_Func.o: No existe el archivo o el directorio
gcc: error: Orbital_Moment.o: No existe el archivo o el directorio
gcc: error: Pot_NeutralAtom.o: No existe el archivo o el directorio
gcc: error: Simple_Mixing_DM.o: No existe el archivo o el directorio
gcc: error: DIIS_Mixing_DM.o: No existe el archivo o el directorio
gcc: error: GR_Pulay_DM.o: No existe el archivo o el directorio
gcc: error: Kerker_Mixing_Rhok.o: No existe el archivo o el directorio
gcc: error: DIIS_Mixing_Rhok.o: No existe el archivo o el directorio
gcc: error: Total_Energy.o: No existe el archivo o el directorio
gcc: error: Contract_Hamiltonian.o: No existe el archivo o el directorio
gcc: error: Contract_iHNL.o: No existe el archivo o el directorio
gcc: error: Cont_Matrix0.o: No existe el archivo o el directorio
gcc: error: Cont_Matrix1.o: No existe el archivo o el directorio
gcc: error: Cont_Matrix2.o: No existe el archivo o el directorio
gcc: error: Cont_Matrix3.o: No existe el archivo o el directorio
gcc: error: Cont_Matrix4.o: No existe el archivo o el directorio
gcc: error: Opt_Contraction.o: No existe el archivo o el directorio
gcc: error: Initial_CntCoes.o: No existe el archivo o el directorio
gcc: error: Initial_CntCoes2.o: No existe el archivo o el directorio
gcc: error: Set_XC_Grid.o: No existe el archivo o el directorio
gcc: error: Get_Orbitals.o: No existe el archivo o el directorio
gcc: error: Get_dOrbitals.o: No existe el archivo o el directorio
gcc: error: Get_Cnt_Orbitals.o: No existe el archivo o el directorio
gcc: error: Get_Cnt_dOrbitals.o: No existe el archivo o el directorio
gcc: error: Gaunt.o: No existe el archivo o el directorio
gcc: error: Find_CGrids.o: No existe el archivo o el directorio
gcc: error: MD_pac.o: No existe el archivo o el directorio
gcc: error: RestartFileDFT.o: No existe el archivo o el directorio
gcc: error: Output_CompTime.o: No existe el archivo o el directorio
gcc: error: Merge_LogFile.o: No existe el archivo o el directorio
gcc: error: Make_FracCoord.o: No existe el archivo o el directorio
gcc: error: Make_InputFile_with_FinalCoord.o: No existe el archivo o el directorio
gcc: error: Divide_Conquer.o: No existe el archivo o el directorio
gcc: error: Krylov.o: No existe el archivo o el directorio
gcc: error: Divide_Conquer_Dosout.o: No existe el archivo o el directorio
gcc: error: Eigen_lapack.o: No existe el archivo o el directorio
gcc: error: Eigen_lapack2.o: No existe el archivo o el directorio
gcc: error: EigenBand_lapack.o: No existe el archivo o el directorio
gcc: error: Eigen_PReHH.o: No existe el archivo o el directorio
gcc: error: BroadCast_ReMatrix.o: No existe el archivo o el directorio
gcc: error: Eigen_PHH.o: No existe el archivo o el directorio
gcc: error: BroadCast_ComplexMatrix.o: No existe el archivo o el directorio
gcc: error: lapack_dstedc1.o: No existe el archivo o el directorio
gcc: error: lapack_dstedc2.o: No existe el archivo o el directorio
gcc: error: lapack_dstedc3.o: No existe el archivo o el directorio
gcc: error: lapack_dstegr1.o: No existe el archivo o el directorio
gcc: error: lapack_dstegr2.o: No existe el archivo o el directorio
gcc: error: lapack_dstegr3.o: No existe el archivo o el directorio
gcc: error: lapack_dstevx1.o: No existe el archivo o el directorio
gcc: error: lapack_dstevx2.o: No existe el archivo o el directorio
gcc: error: lapack_dstevx3.o: No existe el archivo o el directorio
gcc: error: lapack_dstevx4.o: No existe el archivo o el directorio
gcc: error: lapack_dstevx5.o: No existe el archivo o el directorio
gcc: error: lapack_dsteqr1.o: No existe el archivo o el directorio
gcc: error: Nonlocal_Basis.o: No existe el archivo o el directorio
gcc: error: Set_OLP_Kin.o: No existe el archivo o el directorio
gcc: error: Set_Nonlocal.o: No existe el archivo o el directorio
gcc: error: Set_ProExpn_VNA.o: No existe el archivo o el directorio
gcc: error: Set_Hamiltonian.o: No existe el archivo o el directorio
gcc: error: Set_Vpot.o: No existe el archivo o el directorio
gcc: error: Voronoi_Charge.o: No existe el archivo o el directorio
gcc: error: Voronoi_Orbital_Moment.o: No existe el archivo o el directorio
gcc: error: Fuzzy_Weight.o: No existe el archivo o el directorio
gcc: error: dampingF.o: No existe el archivo o el directorio
gcc: error: deri_dampingF.o: No existe el archivo o el directorio
gcc: error: Spherical_Bessel.o: No existe el archivo o el directorio
gcc: error: iterout.o: No existe el archivo o el directorio
gcc: error: iterout_md.o: No existe el archivo o el directorio
gcc: error: Allocate_Arrays.o: No existe el archivo o el directorio
gcc: error: Free_Arrays.o: No existe el archivo o el directorio
gcc: error: Init_List_YOUSO.o: No existe el archivo o el directorio
gcc: error: outputfile1.o: No existe el archivo o el directorio
gcc: error: malloc_multidimarray.o: No existe el archivo o el directorio
gcc: error: PrintMemory.o: No existe el archivo o el directorio
gcc: error: PrintMemory_Fix.o: No existe el archivo o el directorio
gcc: error: dtime.o: No existe el archivo o el directorio
gcc: error: OutData.o: No existe el archivo o el directorio
gcc: error: OutData_Binary.o: No existe el archivo o el directorio
gcc: error: init_alloc_first.o: No existe el archivo o el directorio
gcc: error: File_CntCoes.o: No existe el archivo o el directorio
gcc: error: SCF2File.o: No existe el archivo o el directorio
gcc: error: mimic_sse.o: No existe el archivo o el directorio
gcc: error: Make_Comm_Worlds.o: No existe el archivo o el directorio
gcc: error: Set_Allocate_Atom2CPU.o: No existe el archivo o el directorio
gcc: error: Cutoff.o: No existe el archivo o el directorio
gcc: error: Generating_MP_Special_Kpt.o: No existe el archivo o el directorio
gcc: error: Maketest.o: No existe el archivo o el directorio
gcc: error: Runtest.o: No existe el archivo o el directorio
gcc: error: Memory_Leak_test.o: No existe el archivo o el directorio
gcc: error: Force_test.o: No existe el archivo o el directorio
gcc: error: Show_DFT_DATA.o: No existe el archivo o el directorio
gcc: error: Generate_Wannier.o: No existe el archivo o el directorio
gcc: error: TRAN_Allocate.o: No existe el archivo o el directorio
gcc: error: TRAN_DFT.o: No existe el archivo o el directorio
gcc: error: TRAN_DFT_Dosout.o: No existe el archivo o el directorio
gcc: error: TRAN_Apply_Bias2e.o: No existe el archivo o el directorio
gcc: error: TRAN_Deallocate_Electrode_Grid.o: No existe el archivo o el directorio
gcc: error: TRAN_Deallocate_RestartFile.o: No existe el archivo o el directorio
gcc: error: TRAN_RestartFile.o: No existe el archivo o el directorio
gcc: error: TRAN_Calc_CentGreen.o: No existe el archivo o el directorio
gcc: error: TRAN_Input_std.o: No existe el archivo o el directorio
gcc: error: TRAN_Set_CentOverlap.o: No existe el archivo o el directorio
gcc: error: TRAN_Calc_CentGreenLesser.o: No existe el archivo o el directorio
gcc: error: TRAN_Input_std_Atoms.o: No existe el archivo o el directorio
gcc: error: TRAN_Set_Electrode_Grid.o: No existe el archivo o el directorio
gcc: error: TRAN_Calc_GridBound.o: No existe el archivo o el directorio
gcc: error: TRAN_Set_IntegPath.o: No existe el archivo o el directorio
gcc: error: TRAN_Output_HKS.o: No existe el archivo o el directorio
gcc: error: TRAN_Set_MP.o: No existe el archivo o el directorio
gcc: error: TRAN_Calc_SelfEnergy.o: No existe el archivo o el directorio
gcc: error: TRAN_Output_Trans_HS.o: No existe el archivo o el directorio
gcc: error: TRAN_Calc_Hopping_G.o: No existe el archivo o el directorio
gcc: error: TRAN_Calc_SurfGreen.o: No existe el archivo o el directorio
gcc: error: TRAN_Set_SurfOverlap.o: No existe el archivo o el directorio
gcc: error: TRAN_Add_Density_Lead.o: No existe el archivo o el directorio
gcc: error: TRAN_Add_ADensity_Lead.o: No existe el archivo o el directorio
gcc: error: TRAN_Set_Value.o: No existe el archivo o el directorio
gcc: error: TRAN_Poisson.o: No existe el archivo o el directorio
gcc: error: TRAN_adjust_Ngrid.o: No existe el archivo o el directorio
gcc: error: TRAN_Print.o: No existe el archivo o el directorio
gcc: error: TRAN_Print_Grid.o: No existe el archivo o el directorio
gcc: error: Lapack_LU_inverse.o: No existe el archivo o el directorio
gcc: error: TRAN_Distribute_Node.o: No existe el archivo o el directorio
gcc: error: TRAN_Output_HKS_Write_Grid.o: No existe el archivo o el directorio
gcc: error: TRAN_Credit.o: No existe el archivo o el directorio
gcc: error: TRAN_Check_Region_Lead.o: No existe el archivo o el directorio
gcc: error: TRAN_Check_Region.o: No existe el archivo o el directorio
gcc: error: TRAN_Check_Input.o: No existe el archivo o el directorio
gcc: error: DFTDvdW_init.o: No existe el archivo o el directorio
gcc: error: neb.o: No existe el archivo o el directorio
gcc: error: neb_run.o: No existe el archivo o el directorio
gcc: error: neb_check.o: No existe el archivo o el directorio
gcc: error: TRAN_Allocate_NC.o: No existe el archivo o el directorio
gcc: error: TRAN_DFT_NC.o: No existe el archivo o el directorio
gcc: error: TRAN_Set_CentOverlap_NC.o: No existe el archivo o el directorio
gcc: error: TRAN_Set_SurfOverlap_NC.o: No existe el archivo o el directorio
gcc: error: elpa1.o: No existe el archivo o el directorio
gcc: error: solve_evp_real.o: No existe el archivo o el directorio
gcc: error: solve_evp_complex.o: No existe el archivo o el directorio
make: *** [openmx] Error 1
メンテ
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Re: gcc error ( No.1 )
Date: 2014/12/15 14:27
Name: T.V.T. Duy  <duytvt@issp.u-tokyo.ac.jp>

Hi,

The OpenMP flag for the GCC compiler is -fopenmp, not -openmp. Also, if you have OpenMP, you should not specify -Dnoomp.

Please correct these two points in CC and try again.

Best regards,
T.V.T. Duy
メンテ

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