This thread is locked.Only browsing is available.
Top Page > Browsing
Band structure for SnS2 including Hubbard
Date: 2023/01/31 15:15
Name: Ziba Torkashvand   <zi.torkashvand@gmail.com>

Dear OpenMX users
It's for a while I'm trying to calculate the band structure for bilayer 1T SnS2 including the Hubbard parameter.
After calculating the band structure both with and without the Hubbard parameter, non of my results is close to the reports.
In the literature, the Hubbard parameter for Sn is 9eV for the 4d orbitals and 3.8 for S 3p orbitals(doi.org/10.1016/j.jpcs.2018.04.026).
While my resulting band gaps are 1.378 and 1.432 for with and without Hubbard, in the literature  1.44(2.05) eV is reported for the case of without(with) Hubbard.
following is my input file, I appreciate any help in this regard.


Species.Number                    2
<Definition.of.Atomic.Species
  S    S7.0-s2p3d2f1    S_PBE19
  Sn    Sn7.0-s2p2d4f1    Sn_PBE19
Definition.of.Atomic.Species>

<Hubbard.U.values                #  eV
S  1s 0.0 2s 0.0 1p 0.0 2p 0.0 3p 3.8 1d 0.0 2d 0.0 1f 0.0
Sn  1s 0.0 2s 0.0 1p 0.0 2p 0.0 1d 0.0 2d 0.0 3d 0.0 4d 9.0 1f 0.0
Hubbard.U.values>

Atoms.Number                      96
Atoms.SpeciesAndCoordinates.Unit  Ang
<Atoms.SpeciesAndCoordinates
  1    Sn      0.3072105      2.6716622      8.6044206    7.0  7.0 off
  2    Sn      2.1600223      1.6018325    14.7125980    7.0  7.0 off
  3    S        2.1587630      1.6023017    10.1040373    3.0  3.0 off
  4    S        0.3075179      2.6717008    16.2088696    3.0  3.0 off
  5    S        0.3108033      0.5339885    13.2114840    3.0  3.0 off
  6    S        0.3071659      0.5352491      7.1062136    3.0  3.0 off
  7    Sn      -1.5414644      5.8766439      8.6036754    7.0  7.0 off
  8    Sn      0.3092405      4.8074006    14.7103878    7.0  7.0 off
  9    S        0.3088646      4.8070716    10.1030035    3.0  3.0 off
  10    S      -1.5422339      5.8779412    16.2076664    3.0  3.0 off
  11    S      -1.5400149      3.7377064    13.2118296    3.0  3.0 off
  12    S      -1.5431008      3.7407029      7.1046022    3.0  3.0 off
  13    Sn      -3.3912118      9.0801852      8.6043445    7.0  7.0 off
  14    Sn      -1.5425325      8.0132752    14.7069806    7.0  7.0 off
  15    S      -1.5407802      8.0114698    10.1038174    3.0  3.0 off
  16    S      -3.3939062      9.0800641    16.2074136    3.0  3.0 off
  17    S      -3.3916969      6.9416186    13.2106387    3.0  3.0 off
  18    S      -3.3929947      6.9452702      7.1047647    3.0  3.0 off
  19    Sn      -5.2436939    12.2860434      8.6067809    7.0  7.0 off
  20    Sn      -3.3926805    11.2171353    14.7128822    7.0  7.0 off
  21    S      -3.3916070    11.2162222    10.1040064    3.0  3.0 off
  22    S      -5.2449531    12.2858159    16.2092032    3.0  3.0 off
  23    S      -5.2403115    10.1479119    13.2109304    3.0  3.0 off
  24    S      -5.2438299    10.1505109      7.1070091    3.0  3.0 off
  25    Sn      4.0087560      2.6716033      8.6067545    7.0  7.0 off
  26    Sn      5.8599835      1.6029607    14.7129104    7.0  7.0 off
  27    S        5.8611946      1.6021955    10.1038121    3.0  3.0 off
  28    S        4.0085774      2.6732237    16.2092395    3.0  3.0 off
  29    S        4.0110077      0.5328515    13.2139532    3.0  3.0 off
  30    S        4.0068744      0.5359377      7.1069993    3.0  3.0 off
  31    Sn      2.1574883      5.8766416      8.6042875    7.0  7.0 off
  32    Sn      4.0098274      4.8068496    14.7069364    7.0  7.0 off
  33    S        4.0093365      4.8075432    10.1041265    3.0  3.0 off
  34    S        2.1589699      5.8763760    16.2072136    3.0  3.0 off
  35    S        2.1599046      3.7367090    13.2114590    3.0  3.0 off
  36    S        2.1575703      3.7404909      7.1062307    3.0  3.0 off
  37    Sn      0.3096782      9.0834688      8.6083860    7.0  7.0 off
  38    Sn      2.1579871      8.0127191    14.7102772    7.0  7.0 off
  39    S        2.1609227      8.0118548    10.1042224    3.0  3.0 off
  40    S        0.3060019      9.0810889    16.2080933    3.0  3.0 off
  41    S        0.3098301      6.9428397    13.2105427    3.0  3.0 off
  42    S        0.3074752      6.9477219      7.1064607    3.0  3.0 off
  43    Sn      -1.5438591    12.2870566      8.6055675    7.0  7.0 off
  44    Sn      0.3075447    11.2181235    14.7124590    7.0  7.0 off
  45    S        0.3095611    11.2190566    10.1039949    3.0  3.0 off
  46    S      -1.5433198    12.2870132    16.2108443    3.0  3.0 off
  47    S      -1.5411227    10.1501282    13.2118236    3.0  3.0 off
  48    S      -1.5420071    10.1508399      7.1071242    3.0  3.0 off
  49    Sn      7.7113242      2.6703588      8.6041807    7.0  7.0 off
  50    Sn      9.5596776      1.6025942    14.7070072    7.0  7.0 off
  51    S        9.5622275      1.6007479    10.1017253    3.0  3.0 off
  52    S        7.7104043      2.6730027    16.2074771    3.0  3.0 off
  53    S        7.7095239      0.5325440    13.2118306    3.0  3.0 off
  54    S        7.7078097      0.5349888      7.1051062    3.0  3.0 off
  55    Sn      5.8602075      5.8752356      8.6066768    7.0  7.0 off
  56    Sn      7.7111170      4.8092748    14.7086242    7.0  7.0 off
  57    S        7.7126556      4.8057411    10.1032980    3.0  3.0 off
  58    S        5.8583368      5.8765110    16.2068331    3.0  3.0 off
  59    S        5.8618272      3.7371215    13.2109362    3.0  3.0 off
  60    S        5.8583273      3.7401786      7.1069541    3.0  3.0 off
  61    Sn      4.0109402      9.0800527      8.6053858    7.0  7.0 off
  62    Sn      5.8579040      8.0136023    14.7114411    7.0  7.0 off
  63    S        5.8615012      8.0113522    10.1047076    3.0  3.0 off
  64    S        4.0069468      9.0825661    16.2089252    3.0  3.0 off
  65    S        4.0099737      6.9442857    13.2109570    3.0  3.0 off
  66    S        4.0088817      6.9448425      7.1065988    3.0  3.0 off
  67    Sn      2.1582766    12.2850634      8.6021828    7.0  7.0 off
  68    Sn      4.0087196    11.2182773    14.7102827    7.0  7.0 off
  69    S        4.0096287    11.2170964    10.1022313    3.0  3.0 off
  70    S        2.1577721    12.2884244    16.2081114    3.0  3.0 off
  71    S        2.1589484    10.1488800    13.2124748    3.0  3.0 off
  72    S        2.1580532    10.1489942      7.1059382    3.0  3.0 off
  73    Sn      11.4108344      2.6708438      8.6033724    7.0  7.0 off
  74    Sn      13.2619171      1.6018516    14.7103800    7.0  7.0 off
  75    S      13.2616275      1.6020429    10.1026463    3.0  3.0 off
  76    S      11.4093798      2.6705093    16.2076756    3.0  3.0 off
  77    S      11.4125615      0.5331369    13.2105254    3.0  3.0 off
  78    S      11.4096952      0.5353993      7.1040121    3.0  3.0 off
  79    Sn      9.5618196      5.8752713      8.6044250    7.0  7.0 off
  80    Sn      11.4127711      4.8064916    14.7115017    7.0  7.0 off
  81    S      11.4129022      4.8063516    10.1022729    3.0  3.0 off
  82    S        9.5596441      5.8766695    16.2080053    3.0  3.0 off
  83    S        9.5628739      3.7393099    13.2106118    3.0  3.0 off
  84    S        9.5596576      3.7402458      7.1045093    3.0  3.0 off
  85    Sn      7.7109763      9.0808558      8.6066251    7.0  7.0 off
  86    Sn      9.5594868      8.0107547    14.7086124    7.0  7.0 off
  87    S        9.5630940      8.0109297    10.1033007    3.0  3.0 off
  88    S        7.7091372      9.0821976    16.2068482    3.0  3.0 off
  89    S        7.7097174      6.9440785    13.2105490    3.0  3.0 off
  90    S        7.7091720      6.9451761      7.1071102    3.0  3.0 off
  91    Sn      5.8585413    12.2867617      8.6041313    7.0  7.0 off
  92    Sn      7.7109875    11.2174280    14.7069452    7.0  7.0 off
  93    S        7.7098979    11.2171429    10.1040906    3.0  3.0 off
  94    S        5.8596135    12.2860572    16.2072320    3.0  3.0 off
  95    S        5.8596684    10.1481489    13.2109281    3.0  3.0 off
  96    S        5.8593849    10.1497978      7.1063898    3.0  3.0 off
Atoms.SpeciesAndCoordinates>

Atoms.UnitVectors.Unit            Ang
<Atoms.UnitVectors
  14.8034000  0.0000000  0.0000000
  -7.4017000  12.8201205  0.0000000
  0.0000000  0.0000000  23.3282000
Atoms.UnitVectors>

scf.XcType                    GGA-PBE

# DFT+U part #
scf.Hubbard.U              On          # On|Off, default=off
scf.Hubbard.Occupation    dual        # onsite|full|dual, default=dual
scf.DFTU.Type       1          # 1:Simplified(Dudarev)|2:General, default=1
scf.dc.Type                sFLL       # sFLL|sAMF|cFLL|cAMF, default=sFLL
scf.Slater.Ratio          0.625      # default=0.625
scf.Yukawa           off        # default=off

scf.SpinPolarization          on
scf.ElectronicTemperature    300.0
scf.energycutoff              300.0
scf.maxIter                  500
scf.EigenvalueSolver          band
scf.Kgrid                    4  4  1
scf.Mixing.Type              rmm-diisk
scf.Init.Mixing.Weight        0.20
scf.Min.Mixing.Weight        0.01
scf.Max.Mixing.Weight        0.30
scf.Kerker.factor            1.00       
scf.Mixing.History            5
scf.Mixing.StartPulay        6
scf.criterion                1.0e-7

#
# MD or Geometry Optimization
#

MD.Type                    nomd      # Nomd|Opt|DIIS|NVE|NVT_VS|NVT_NH
MD.maxIter                  1        # default=1
MD.TimeStep                0.05      # default=0.5 (fs)
MD.Opt.criterion          1.0e-4      # default=1.0e-4 (Hartree/bohr)

Band.dispersion              on      # on|off, default=off
Band.Nkpath                  3
<Band.kpath
  50 0.00000000000 0.00000000000 0.0000000000  0.333333333333 0.33333333333 0.0000000000 G M
  50 0.33333333333 0.33333333333 0.0000000000  0.500000000000 0.00000000000 0.0000000000 M K
  50 0.50000000000 0.00000000000 0.0000000000  0.00000000000 0.00000000000 0.00000000000 K G
Band.kpath>
メンテ
Page: [1]

Re: Band structure for SnS2 including Hubbard ( No.1 )
Date: 2023/02/01 21:46
Name: Aleksey Baglov

Hi,
A few thoughts.
1. Basis set can be reduced almost without accuracy loss. Try standard or even quick choices.
    Quick:
S  S7.0-s2p2d1  S_PBE19
Sn  Sn7.0-s3p2d1  Sn_PBE19
    Standard:
S  S7.0-s2p2d1f1  S_PBE19
Sn  Sn7.0-s3p2d2  Sn_PBE19
2. If you have two or more PAOs on orbital use you need to be careful with Hubbard’s parameter. Use it for the first value of PAOs set. Example: basis s2p2d1, Hubbard 1s 0.0  2s 0.0  1p  5.0  2p 0.0  1d 0.0. In general, you need to know, how to influence each PAO from a basis set on the band structure. You can combine different values for different PAO: 1p 3.3  2p 5.1  3p 0.1, but you need to know, why you do it.
3. Hubbard’s parameter values from calculations within the plane wave basis set (VASP, Quantum ESPRESSO) are not equivalence for the localized basis set (OpenMX). From my experience, the OpenMX should be used a smaller value of Hubbard’s parameter for reproducing plane wave codes results.

Good luck!
メンテ
Re: Band structure for SnS2 including Hubbard ( No.2 )
Date: 2023/02/06 16:08
Name: Ziba Torkashvand  <zi.torkashvand@gmail.com>

Thank you Dr. Baglov for your explanation.
Actually, I have tried so many sets of values but unfortunately, for large numbers, it can not be converged and for lower ones, there is no difference in bandgap with respect to without Hubbard.

Regards,
Ziba
メンテ

Page: [1]