その他

プログラム

本プログラムパッケージは1つのmakefileと、C言語とF90言語で記述されたルーチンで構成されています。

    makefile,

また21個のヘッダーファイルが含まれます。

    exx_debug.h         exx_file_eri.h    exx.h                exx_interface_openmx.h  
    exx_rhox.h          exx_step2.h       exx_xc.h             Inputtools.h         
    mimic_sse.h         read_scfout.h     tran_variables.h     exx_def_openmx.h  
    exx_file_overlap.h  exx_index.h       exx_log.h            exx_step1.h  
    exx_vector.h        f77func.h         lapack_prototypes.h  openmx_common.h  
    tran_prototypes.h

全部で265個のプログラムルーティンから構成されており、その内訳を以下に記載します。

   add_gcube.c                  get_elpa_row_col_comms.f90        SCF2File.c
   Allocate_Arrays.c            Get_OneD_HS_Col.c                 Set_Aden_Grid.c
   analysis_example.c           Get_Orbitals.c                    Set_Allocate_Atom2CPU.c
   AngularF.c                   GR_Pulay_DM.c                     Set_Density_Grid.c
   Band_DFT_Col.c               Hamiltonian_Band.c                Set_Hamiltonian.c
   Band_DFT_Dosout.c            Hamiltonian_Band_NC.c             Set_Initial_DM.c
   Band_DFT_kpath.c             Hamiltonian_Cluster.c             Set_Nonlocal.c
   Band_DFT_MO.c                Hamiltonian_Cluster_NC.c          Set_OLP_Kin.c
   Band_DFT_NonCol.c            Hamiltonian_Cluster_SO.c          Set_Orbitals_Grid.c
   bandgnu13.c                  init_alloc_first.c                SetPara_DFT.c
   Bench_MatMul.c               init.c                            Set_ProExpn_VNA.c
   BentNT.c                     Initial_CntCoes2.c                Set_Vpot.c
   bin2txt.c                    Initial_CntCoes.c                 Set_XC_Grid.c
   BroadCast_ComplexMatrix.c    Init_List_YOUSO.c                 Show_DFT_DATA.c
   BroadCast_ReMatrix.c         Input_std.c                       Simple_Mixing_DM.c
   check_lead.c                 Inputtools.c                      Smoothing_Func.c
   Cluster_DFT.c                io_tester.c                       solve_evp_complex.f90
   Cluster_DFT_Dosout.c         iterout.c                         solve_evp_real.f90
   Cluster_DFT_ON2.c            iterout_md.c                      Spherical_Bessel.c
   Cont_Matrix0.c               jx.c                              test_mpi2.c
   Cont_Matrix1.c               Kerker_Mixing_Rhok.c              test_mpi3.c
   Cont_Matrix2.c               Krylov.c                          test_mpi4.c
   Cont_Matrix3.c               KumoF.c                           test_mpi.c
   Cont_Matrix4.c               lapack_dstedc1.c                  test_openmp2.c
   Contract_Hamiltonian.c       lapack_dstedc2.c                  test_openmp3.c
   Contract_iHNL.c              lapack_dstedc3.c                  test_openmp.c
   Cutoff.c                     lapack_dstegr1.c                  Tetrahedron_Blochl.c
   dampingF.c                   lapack_dstegr2.c                  Timetool.c
   deri_dampingF.c              lapack_dstegr3.c                  Total_Energy.c
   DFT.c                        lapack_dsteqr1.c                  TRAN_Add_ADensity_Lead.c
   DFTDvdW_init.c               lapack_dstevx1.c                  TRAN_Add_Density_Lead.c
   diff_gcube.c                 lapack_dstevx2.c                  TRAN_adjust_Ngrid.c
   diff_geo.c                   lapack_dstevx3.c                  TRAN_Allocate.c
   DIIS_Mixing_DM.c             lapack_dstevx4.c                  TRAN_Allocate_NC.c
   DIIS_Mixing_Rhok.c           lapack_dstevx5.c                  TRAN_Apply_Bias2e.c
   Divide_Conquer.c             Lapack_LU_inverse.c               TRAN_Calc_CentGreen.c
   Divide_Conquer_Dosout.c      LU_inverse.c                      TRAN_Calc_CentGreenLesser.c
   DosMain.c                    Make_Comm_Worlds.c                TRAN_Calc_GridBound.c
   Dr_KumoF.c                   Make_FracCoord.c                  TRAN_Calc_Hopping_G.c
   Dr_RadialF.c                 Make_InputFile_with_FinalCoord.c  TRAN_Calc_OneTransmission.c
   Dr_VH_AtomF.c                Maketest.c                        TRAN_Calc_SelfEnergy.c
   Dr_VNAF.c                    malloc_multidimarray.c            TRAN_Calc_SurfGreen.c
   dtime.c                      MD_pac.c                          TRAN_Calc_SurfGreen_Sanvito.c
   Eff_Hub_Pot.c                Memory_Leak_test.c                TRAN_Check_Input.c
   EigenBand_lapack.c           Merge_LogFile.c                   TRAN_Check_Region.c
   Eigen_lapack2.c              mimic_sse.c                       TRAN_Check_Region_Lead.c
   Eigen_lapack.c               Mio_tester2.c                     TRAN_Credit.c
   Eigen_PHH.c                  Mio_tester.c                      TRAN_Deallocate_Electrode_Grid.c
   Eigen_PReHH.c                Mixing_DM.c                       TRAN_Deallocate_RestartFile.c
   elpa1.f90                    mpao.c                            TRAN_DFT.c
   esp.c                        mpi_multi_world2.c                TRAN_DFT_Dosout.c
   EulerAngle_Spin.c            mpi_multi_world.c                 TRAN_DFT_NC.c
   expao.c                      mpi_non_blocking.c                TRAN_Distribute_Node.c
   exx.c                        Mulliken_Charge.c                 TRAN_Input_std_Atoms.c
   exx_debug.c                  neb.c                             TRAN_Input_std.c
   exx_file_eri.c               neb_check.c                       TranMain.c
   exx_file_overlap.c           neb_run.c                         TranMain_NC.c
   exx_index.c                  Nonlocal_Basis.c                  TRAN_Output_HKS.c
   exx_interface_openmx.c       Nonlocal_RadialF.c                TRAN_Output_HKS_Write_Grid.c
   exx_log.c                    Occupation_Number_LDA_U.c         TRAN_Output_Trans_HS.c
   exx_rhox.c                   openmx.c                          TRAN_Poisson.c
   exx_step1.c                  openmx_common.c                   TRAN_Print.c
   exx_step2.c                  Opt_Contraction.c                 TRAN_Print_Grid.c
   exx_vector.c                 OpticalConductivityMain.c         TRAN_Read.c
   exx_xc.c                     Orbital_Moment.c                  TRAN_RestartFile.c
   File_CntCoes.c               OutData_Binary.c                  TRAN_Set_CentOverlap.c
   Find_CGrids.c                OutData.c                         TRAN_Set_CentOverlap_NC.c
   find_Emin0.c                 Output_CompTime.c                 TRAN_Set_Electrode_Grid.c
   find_Emin2.c                 outputfile1.c                     TRAN_Set_IntegPath.c
   find_Emin.c                  Overlap_Band.c                    TRAN_Set_MP.c
   find_Emin_withS.c            Overlap_Cluster.c                 TRAN_Set_SurfOverlap.c
   Force.c                      pdb2pao.c                         TRAN_Set_SurfOverlap_NC.c
   Force_HNL.c                  PhiF.c                            TRAN_Set_Value.c
   Force_test.c                 Poisson.c                         truncation.c
   frac2xyz.c                   Poisson_ESM.c                     unit2xyz.c
   Free_Arrays.c                polB.c                            VH_AtomF.c
   FT_NLP.c                     Pot_NeutralAtom.c                 VNAF.c
   FT_PAO.c                     PrintMemory.c                     Voronoi_Charge.c
   FT_ProductPAO.c              PrintMemory_Fix.c                 Voronoi_Orbital_Moment.c
   FT_ProExpn_VNA.c             QuickSort.c                       XC_CA_LSDA.c
   FT_VNA.c                     RadialF.c                         XC_Ceperly_Alder.c
   Fuzzy_Weight.c               readfile.c                        XC_EX.c
   Gaunt.c                      read_scfout.c                     XC_PBE.c
   Gauss_Legendre.c             ReLU_inverse.c                    XC_PW92C.c
   Generate_Wannier.c           RestartFileDFT.c                  xyz2spherical.c
   Generating_MP_Special_Kpt.c  RF_BesselF.c                      zero_cfrac.c
   Get_Cnt_dOrbitals.c          rmmpi.c                           zero_fermi.c
   Get_Cnt_Orbitals.c           rot.c
   Get_dOrbitals.c              Runtest.c

さらに、次のライブラリーパッケージがリンクされています。

    lapack,
    blas,
    fftw,
    MPICH or LAM
    omp

プログラムパッケージの版権

このプログラムパッケージの配布は、GNU General Public License [59]の方式に従っています。 またオリジナルプログラムの作者である尾崎泰助がこのプログラムパッケージのオリジナルバージョンの版権を所有しています。 我々はこのプログラムパッケージのユーザーの利用に関して、いかなる保証もできません。 しかしプログラムのバグを報告して頂ければ、問題解決に向けて出来る限り利用者と共に協力し作業を行うつもりです。

謝辞

我々の一人（T.O.）は、有益な示唆とコメントをいただいたJRCATとRICS-AISTの多数の仲間に感謝いたします。 我々の一人（T.O.）は、次の国家プロジェクトによって支援を受けました。

• NEDOのナノ機能合成技術プロジェクト(SYNAF-NEDO) [93]
• 科学技術振興機構の計算科学技術活用型特定研究開発推進事業(ACT-JST) [94]
• 文部科学省の最先端・高性能汎用スーパーコンピュータの開発利用プロジェクト(NAREGI) [95]
• 科学技術振興機構の戦略的創造研究推進事業(CREST-JST) [96]
• 文部科学省科学研究費補助金「新学術領域研究」コンピューティクスによる物質デザイン [97]
• 文部科学省「HPCI戦略プログラム (SPIRE)」分野2＜新物質･エネルギー創成＞ 計算物質科学イニシアティブ (CMSI) [98]

ご協力に深く感謝申し上げます。