制約条件付き分子動力学

原子座標を初期位置に固定して分子動力学計算を行うための制約MDシミュレーションが実行可能です。 「制約条件付の構造最適化」の節で述べたのと同じ方法で設定します。指定方法はそちらの節を参照してください。