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その他

プログラム

本プログラムパッケージはC言語とF90言語で記述されたルーチン、1つのmakefileで構成されています。

    makefile,

また34個のヘッダーファイルが含まれます。

  BandDispersion.h Circular_Search.h EigenValue_Problem.h Eigen_HH.h GetOrbital.h
  Inputtools.h Tools_BandCalc.h Tools_Search.h exx.h exx_debug.h exx_def_openmx.h
  exx_file_eri.h exx_file_overlap.h exx_index.h exx_interface_openmx.h
  exx_log.h exx_rhox.h exx_step1.h exx_step2.h exx_vector.h exx_xc.h f77func.h
  jx.h jx_LNO.h jx_config.h jx_quicksort.h jx_tools.h jx_total_mem.h
  lapack_prototypes.h mimic_sse.h openmx_common.h read_scfout.h tran_prototypes.h
  tran_variables.h

全部で350個のプログラムルーティンから構成されており、その内訳を以下に記載します。

   ADIIS_Mixing_DM.c ADenBand.c Allocate_Arrays.c AngularF.c BandDispersion.c Band_DFT_Col.c
   Band_DFT_Col_NEGF.c Band_DFT_Col_Optical_ScaLAPACK.c Band_DFT_Dosout.c Band_DFT_MO.c
   Band_DFT_NonCol.c Band_DFT_NonCol_GB.c Band_DFT_NonCol_Optical.c Band_DFT_kpath.c
   Band_DFT_kpath_LNO.c Band_Dispersion.c Bench_MatMul.c BentNT.c BroadCast_ComplexMatrix.c
   BroadCast_ReMatrix.c Calc_optical.c Circular_Search.c Cluster_DFT_Col.c Cluster_DFT_Dosout.c
   Cluster_DFT_LNO.c Cluster_DFT_NonCol.c Cluster_DFT_ON2.c Cluster_DFT_OptOrb.c
   Cluster_DFT_Optical.c Cluster_DFT_Optical_ScaLAPACK.c Cluster_DFT_ScaLAPACK.c Cont_Matrix0.c
   Cont_Matrix1.c Cont_Matrix2.c Cont_Matrix3.c Cont_Matrix4.c Contract_Hamiltonian.c
   Contract_iHNL.c Coulomb_Interaction.c Cutoff.c DFT.c DFTD3vdW_init.c DFTDvdW_init.c
   DIIS_Mixing_DM.c DIIS_Mixing_Rhok.c Divide_Conquer.c Divide_Conquer_Dosout.c
   Divide_Conquer_LNO.c DosMain.c Dr_KumoF.c Dr_RadialF.c Dr_VH_AtomF.c Dr_VNAF.c
   EGAC_DFT.c Eff_Hub_Pot.c EigenBand_lapack.c EigenValue_Problem.c Eigen_HH.c Eigen_PHH.c 
   Eigen_PReHH.c Eigen_lapack.c Eigen_lapack2.c Eigen_lapack3.c Embedded_GFM.c EulerAngle_Spin.c 
   FT_NLP.c FT_PAO.c FT_ProExpn_VNA.c FT_ProductPAO.c FT_VNA.c FermiLoop.c File_CntCoes.c
   Find_CGrids.c Force.c Force_test.c Free_Arrays.c Fuzzy_Weight.c GR_Pulay_DM.c Gaunt.c
   Gauss_Legendre.c Generate_Wannier.c Generating_MP_Special_Kpt.c GetOrbital.c 
   Get_Cnt_Orbitals.c Get_Cnt_dOrbitals.c Get_OneD_HS_Col.c Get_Orbitals.c Get_dOrbitals.c
   GridCalc.c Hamiltonian_Band.c Hamiltonian_Band_NC.c Hamiltonian_Band_NC_Hs2.c
   Hamiltonian_Cluster.c Hamiltonian_Cluster_Hs.c Hamiltonian_Cluster_NC.c
   Hamiltonian_Cluster_NC_Hs2.c Hamiltonian_Cluster_SO.c Hamiltonian_NC_Hs2.c
   Init_List_YOUSO.c Initial_CntCoes.c Initial_CntCoes2.c Input_std.c Inputtools.c
   Inputtools_kSpin.c Kerker_Mixing_Rhok.c Krylov.c KumoF.c LNO.c LU_inverse.c
   Lapack_LU_inverse.c MD_pac.c MTRAN_EigenChannel.c Make_Comm_Worlds.c Make_FracCoord.c
   Make_InputFile_with_FinalCoord.c Maketest.c Matrix_Band_LNO.c Memory_Leak_test.c
   Merge_LogFile.c Mio_tester.c Mio_tester2.c Mixing_DM.c Mixing_H.c Mixing_V.c
   MulPCalc.c MulPOnly.c Mulliken_Charge.c NBO_Cluster.c NBO_Krylov.c NabraMatrixElements.c
   Nonlocal_Basis.c Nonlocal_RadialF.c Occupation_Number_LDA_U.c Opt_Contraction.c
   OpticalConductivityMain.c Orbital_Moment.c OutData.c OutData_Binary.c Output_CompTime.c
   Output_Energy_Decomposition.c Overlap_Band.c Overlap_Band_NC_Ss2.c Overlap_Cluster.c
   Overlap_Cluster_LNO.c Overlap_Cluster_NC_Ss2.c Overlap_Cluster_Ss.c PhiF.c
   Poisson.c Poisson_ESM.c Population_Analysis_Wannier.c Population_Analysis_Wannier2.c
   Pot_NeutralAtom.c PrintMemory.c PrintMemory_Fix.c QuickSort.c RF_BesselF.c
   RadialF.c ReLU_inverse.c RestartFileDFT.c Runtest.c SCF2File.c SetPara_DFT.c
   Set_Aden_Grid.c Set_Allocate_Atom2CPU.c Set_ContMat_Cluster_LNO.c Set_CoreHoleMatrix.c
   Set_Density_Grid.c Set_Hamiltonian.c Set_Initial_DM.c Set_Nonlocal.c Set_OLP_Kin.c
   Set_OLP_p.c Set_Orbitals_Grid.c Set_ProExpn_VNA.c Set_Vpot.c Set_XC_Grid.c
   Set_dOrbitals_Grid.c Show_DFT_DATA.c SigmaEK.c Simple_Mixing_DM.c Smoothing_Func.c 
   Spherical_Bessel.c Stress.c Stress_test.c TRAN_Add_ADensity_Lead.c TRAN_Add_Density_Lead.c
   TRAN_Allocate.c TRAN_Allocate_NC.c TRAN_Apply_Bias2e.c TRAN_Band.c TRAN_Band_Col.c 
   TRAN_CDen_Main.c TRAN_Calc_CentGreen.c TRAN_Calc_CentGreenLesser.c TRAN_Calc_CurrentDensity.c
   TRAN_Calc_GridBound.c TRAN_Calc_Hopping_G.c TRAN_Calc_OneTransmission.c TRAN_Calc_SelfEnergy.c
   TRAN_Calc_SurfGreen.c TRAN_Calc_SurfGreen_Sanvito.c TRAN_Channel_Functions.c TRAN_Channel_Output.c
   TRAN_Check_Input.c TRAN_Check_Region.c TRAN_Check_Region_Lead.c TRAN_Credit.c TRAN_DFT.c
   TRAN_DFT_Dosout.c TRAN_DFT_NC.c TRAN_Deallocate_Electrode_Grid.c TRAN_Deallocate_RestartFile.c
   TRAN_Distribute_Node.c TRAN_Input_std.c TRAN_Input_std_Atoms.c TRAN_Input_std_Atoms0.c
   TRAN_Input_std_Atoms2.c TRAN_Main_Analysis.c TRAN_Main_Analysis_NC.c TRAN_Output_HKS.c
   TRAN_Output_HKS_Write_Grid.c TRAN_Output_Trans_HS.c TRAN_Poisson.c TRAN_Print.c TRAN_Print_Grid.c
   TRAN_Read.c TRAN_RestartFile.c TRAN_Set_CentOverlap.c TRAN_Set_CentOverlap_NC.c 
   TRAN_Set_Electrode_Grid.c TRAN_Set_IntegPath.c TRAN_Set_MP.c TRAN_Set_SurfOverlap.c
   TRAN_Set_SurfOverlap_NC.c TRAN_Set_Value.c TRAN_adjust_Ngrid.c Tetrahedron_Blochl.c Timetool.c
   Tools_BandCalc.c Tools_Search.c Total_Energy.c Unfolding_Bands.c VH_AtomF.c VNAF.c 
   Voronoi_Charge.c Voronoi_Orbital_Moment.c XANES0.c XC_CA_LSDA.c XC_Ceperly_Alder.c XC_EX.c
   XC_PBE.c XC_PW92C.c Z2FH.c add_gcube.c analysis_example.c bandgnu13.c bin2txt.c calB.c
   check_lead.c cube2xsf.c dampingF.c deri_dampingF.c diff_gcube.c diff_geo.c dtime.c esp.c
   example_mpi_spawn.c expao.c exx.c exx_debug.c exx_file_eri.c exx_file_overlap.c exx_index.c
   exx_interface_openmx.c exx_log.c exx_rhox.c exx_step1.c exx_step2.c exx_vector.c exx_xc.c
   find_Emin.c find_Emin0.c find_Emin2.c find_Emin_withS.c frac2xyz.c gcube2oned.c gen_defile.c
   init.c init_alloc_first.c intensity_map.c io_tester.c iterout.c iterout_md.c jx.c jx_LNO.c
   jx_band_indiv.c jx_band_psum.c jx_cluster.c jx_config.c jx_quicksort.c jx_tools.c kSpin.c
   lapack_dstedc1.c lapack_dstedc2.c lapack_dstedc3.c lapack_dstegr1.c lapack_dstegr2.c
   lapack_dstegr3.c lapack_dsteqr1.c lapack_dstevx1.c lapack_dstevx2.c lapack_dstevx3.c
   lapack_dstevx4.c lapack_dstevx5.c malloc_multidimarray.c md2axsf.c mimic_sse.c mpao.c
   mpi_multi_world.c mpi_multi_world2.c mpi_non_blocking.c neb.c neb_check.c neb_run.c
   openmx.c openmx_common.c outputfile1.c pdb2pao.c polB.c read_scfout.c readfile.c rmmpi.c
   rot.c test_mpi.c test_mpi2.c test_mpi3.c test_mpi4.c test_openmp.c test_openmp2.c
   test_openmp3.c tp.c truncation.c unit2xyz.c xyz2spherical.c zero_cfrac.c zero_fermi.c
   elpa1.f90 get_elpa_row_col_comms.f90 solve_evp_complex.f90 solve_evp_real.f90

さらに、次のライブラリーパッケージがリンクされています。

    lapack,
    blas,
    fftw,
    MPICH2 or OpenMP

プログラムパッケージの版権

このプログラムパッケージの配布は、GNU General Public License version 3 (GPLv3)[102]の規約に従っています。またオリジナルプログラムの作者である尾崎泰助がこのプログラムパッケージのオリジナルバージョンの版権を所有しています。我々はこのプログラムパッケージのユーザーの利用に関して、いかなる保証もできません。しかしプログラムのバグを報告して頂ければ、問題解決に向けて可能な限り、利用者と共に協力して作業を行う所存です。

謝辞

本プログラムの作成にあたり、有益な示唆とコメントをいただいたJRCAT、RICS-AIST、JAIST、そしてISSPの皆様に感謝いたします（T.O.）。また、次の国家プロジェクトによって支援を受けました。

NEDOのナノ機能合成技術プロジェクト(SYNAF-NEDO) [154]
科学技術振興機構の計算科学技術活用型特定研究開発推進事業(ACT-JST) [155]
文部科学省の最先端・高性能汎用スーパーコンピュータの開発利用プロジェクト(NAREGI) [156]
科学技術振興機構の戦略的創造研究推進事業(CREST-JST) [157]
文部科学省科学研究費補助金「新学術領域研究」コンピューティクスによる物質デザイン [158]
文部科学省「HPCI戦略プログラム (SPIRE)」分野2<新物質・エネルギー創成> 計算物質科学イニシアティブ (CMSI) [159]
NEDOの超先端材料超高速開発基盤技術プロジェクト [160]
文部科学省「ポスト京重点課題7・次世代の産業を支える新機能デバイス・高性能材料の創成」プロジェクト [161]

ご協力に深く感謝申し上げます。