それぞれの原子に有効電荷を割り当てるのは恣意性を含んだ難しい問題ですが、 OpenMXでは各原子の電荷状態を解析するためにMulliken電荷解析、 Voronoi電荷解析、また静電ポテンシャルフィッティング法(ESP)の3つの方法が利用可能です。